Entre documentaire animalier et fiction, Mistigri des toits s'intéresse à la vie des animaux sauvages en milieu urbain, à travers le regard humanisé d’un chat de gouttière. Une invitation insolite à découvrir la ville dans ses moindres recoins. Mistigri est un chat de gouttière habitant en centre-ville, avec comme port d'attache l'appartement d'un professeur naturaliste en fin de carrière, Sophie, qui souhaite aller vivre à la campagne. Au fil des saisons et de sa propre histoire, le chat parcourt la ville, à la recherche des différentes espèces d'animaux domestiques et sauvages présents en milieu urbain. Rats, souris, oiseaux des jardins et prédateurs lancés à leurs trousses, bandes de martinets estivaux ou encore chauves-souris : les espèces animales qui vivent aux côtés des hommes dans les villes sont nombreuses. Passionné par ce qu'il découvre, le chat suivra-t-il Sophie dans son départ à la campagne ? Au-delà des informations en matière de biologie et de comportements des animaux sauvages en milieu urbain, ce film est une ode à la ville.